《中文核心期刊要目总览》历版均采用了定量与定性相结合的评价方法，在定量评价的基础上，通过专家定性评价进行调整补充，力求使研究结果更具科学性、客观性和实用性。定性评价具体流程如下。
1.选聘核心期刊评审专家
（1）通过各种途径广泛收集学科专家（具有正高职称）信息，建立专家数据库。
（2）征聘学科评审专家。通过向各位学科专家发送电子邮件，邀请他们参加核心期刊的网上评审。
2.通过网络进行专家评审
送专家评审材料，含3个部分：
（1）《中文核心期刊要目总览》研究概况，主要介绍本项目的研究背景、目的和方法。
（2）《中文核心期刊要目总览》专家评审原则及具体评审方法。
（3）学科期刊送审表。
学科期刊送审表由核心区和扩展区两部分组成，从学科期刊定量评价排序表中顺序截取。其中，核心区为定量评价初定的核心期刊，扩展区期刊的数量约为核心区的0.5~1.0倍。学科期刊送审表中还列入了入选期刊的全部定量评价数据和书目数据，如综合评价排序号、隶属度（加权平均后的综合评价值）、各评价指标的统计数据、各评价指标的权重等，供专家评审时参考。
3.专家评审内容
（1）调整学科核心期刊排序。核心区期刊的排序反映了期刊的学术水平和影响力，如果专家认为定量排序不符合客观实际，可以调整核心区期刊的排序位置，并说明理由。
（2）调整学科核心期刊表。如果专家认为扩展区汇总存在比核心区中学术水平高的期刊，可以将此刊调入核心区中的恰当位置，并说明理由。此时，核心区排位最后的期刊将落入扩展区；同样，如果专家认为核心区中的某种期刊的水平不高，不适宜排在核心区内，也可将其调出核心区，核心区内其余各刊的位置将顺序变化。
（3）增补优秀期刊进入学科核心期刊表。如果专家评审后认为送审期刊表有重大遗漏，需要补充表外期刊进入核心区，则可以在相应的位置添加新刊，并说明理由。此时，核心区中排位在最后的期刊将落入扩展区。
（4）修改学科核心期刊数量。如果专家对项目组测定的学科期刊数量有不同意见，可以修改学科核心期刊的数量，并说明理由。
4.汇总审定专家评审结果
专家评审结束后，项目组汇总评审专家意见，汇总方法如下。
（1）采用求平均值的方法汇总并计算专家评审后的各学科核心期刊数量
：
其中，J为参评专家人数，
为第 j 个专家确定的第 i 个学科的核心期刊数量。
（2）采用求平均值的方法汇总并计算专家评审后各期刊的排序值
：
其中，J为参评专家人数，
为第 j 个专家确定的第 i 种期刊的排序号。
（3）学科期刊表按汇总专家意见后的序号排序，得到新的学科核心期刊表。
（4）项目组审定专家评审意见。对被专家调整排序的期刊再审查数据，对专家评审调出或新增进入核心区的期刊以及专家意见相左的期刊，除了审查数据外还要审阅刊物，有的还需要进一步征求专家意见。